Respecto al grupo de las aves, se ha observado la presencia de distintas especies entre las que se destacan: el loro barranquero, el pepitero de collar, la monterita canela, el hornero común, la chuña chica, el caserote castaño, el verdón, la monterita de collar y el pepitero chico.
Según el informe citado, Quijadas constituye una zona importante en la conservación de las poblaciones de aves ya que representa un buen lugar de alimentación, reproducción y refugio. Se ha mencionado también la existencia de varios tipos de aves rapaces, entre ellas, el águila coronada y el águila mora. Es importante mencionar además la presencia de otras especies como: el halcón peregrino, que está considerado como vulnerable en el orden internacional y nacional. El ñandú, el cardenal amarillo y el cóndor, a su vez, figuran en el listado de especies cuya comercialización está prohibida o regulada a escala nacional y/o internacional.

El pato gargantilla, el pato maicero, el yal plomizo, el comesebo andino, la dormilona canela, la dormilona chica, el taguató común, el gaucho chico, el jilguero oliváceo, el piojito vientre blanco y el vencejo serrano son especies con pocas o ninguna cita para la Provincia de San Luis y se encuentran presentes en Quijadas. Recientemente se ha citado por primera vez para la provincia de San Luis a la monjita salinera, una especie endémica de Argentina.

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